دانشگاه علوم پزشکي تهران در جديدترين نتايج نظام معتبر رتبه‌بندي شانگهاي (سال 2025) با قرار گرفتن در بازه رتبه‌اي 500 – 401 عنوان برترين دانشگاه کشور را از آن خود کرده است.در اين رتبه‌بندي اسامي و جايگاه 1000 دانشگاه برتر جهان منتشر شده که 6 دانشگاه از جمهوري اسلامي ايران نيز در اين ليست وجود دارد.براساس نتايج اين رتبه بندي، دانشگاه علوم پزشکي تهران در رتبه نخست و دانشگاه‌هاي تهران، تربيت مدرس، علوم پزشکي شهيد بهشتي، صنعتي شريف و علوم پزشکي ايران نيز به ترتيب در رده‌هاي بعدي، دانشگاه‌هاي برترين کشور قرار دارند.در ويرايش 2025 ميلادي رتبه‌بندي شانگهاي، بيش از 2500 دانشگاه مورد ارزيابي قرار گرفته که نام 1000 دانشگاه برتر آن منتشر شده است. اسامي 51 دانشگاه از کشورهاي اسلامي نيز در اين فهرست ديده مي‌شود.نظام رتبه‌بندي شانگهاي با تکيه بر شاخص‌هايي همچون وجود برندگان جايزه نوبل و مدال فيلدز، تعداد محققان پراستناد و همچنين انتشار مقالات در مجلات معتبر "نيچر" و "ساينس"، اقدام به ارزيابي موسسات آموزش عالي مي‌کند. همچنين تعداد مقالات نمايه‌شده در نمايه استنادي توسعه‌يافته علوم (SCIE) و نمايه استنادي علوم اجتماعي (SSCI) از ديگر معيارهاي اين رتبه‌بندي است.
